Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM23P36406 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms