Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGCLP35914 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGCLP35914 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms