Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBSP35520 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBSP35520 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBSP35520 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBSP35520 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBSP35520 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSP35520 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSP35520 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSP35520 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSP35520 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSP35520 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSP35520 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBSP35520 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBSP35520 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSP35520 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSP35520 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSP35520 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSP35520 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSP35520 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSP35520 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSP35520 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSP35520 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSP35520 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSP35520 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSP35520 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSP35520 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSP35520 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSP35520 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSP35520 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSP35520 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSP35520 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSP35520 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSP35520 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSP35520 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSP35520 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSP35520 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSP35520 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSP35520 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSP35520 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSP35520 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSP35520 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSP35520 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSP35520 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSP35520 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSP35520 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSP35520 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSP35520 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSP35520 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSP35520 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSP35520 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSP35520 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSP35520 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSP35520 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBSP35520 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms