Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFTPDP35247 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms