Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX2P32243 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTX2P32243 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTX2P32243 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTX2P32243 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX2P32243 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OTX2P32243 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX2P32243 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX2P32243 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX2P32243 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX2P32243 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX2P32243 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX2P32243 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX2P32243 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX2P32243 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX2P32243 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTX2P32243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTX2P32243 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTX2P32243 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX2P32243 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX2P32243 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX2P32243 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX2P32243 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX2P32243 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX2P32243 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX2P32243 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX2P32243 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX2P32243 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX2P32243 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX2P32243 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTX2P32243 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTX2P32243 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTX2P32243 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTX2P32243 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTX2P32243 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTX2P32243 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTX2P32243 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OTX2P32243 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX2P32243 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX2P32243 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX2P32243 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX2P32243 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX2P32243 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX2P32243 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX2P32243 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX2P32243 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTX2P32243 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTX2P32243 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTX2P32243 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTX2P32243 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTX2P32243 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTX2P32243 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTX2P32243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTX2P32243 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX2P32243 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX2P32243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX2P32243 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX2P32243 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX2P32243 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX2P32243 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX2P32243 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX2P32243 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX2P32243 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX2P32243 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX2P32243 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX2P32243 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms