Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPOP30536 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPOP30536 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPOP30536 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPOP30536 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSPOP30536 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSPOP30536 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSPOP30536 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSPOP30536 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPOP30536 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPOP30536 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPOP30536 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPOP30536 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPOP30536 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPOP30536 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPOP30536 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPOP30536 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPOP30536 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPOP30536 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPOP30536 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSPOP30536 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSPOP30536 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSPOP30536 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPOP30536 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPOP30536 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPOP30536 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms