Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCND2P30279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCND2P30279 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND2P30279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND2P30279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND2P30279 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND2P30279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND2P30279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCND2P30279 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCND2P30279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND2P30279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND2P30279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND2P30279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND2P30279 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND2P30279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND2P30279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND2P30279 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND2P30279 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND2P30279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND2P30279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND2P30279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND2P30279 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND2P30279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND2P30279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND2P30279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND2P30279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND2P30279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND2P30279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND2P30279 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND2P30279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND2P30279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND2P30279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND2P30279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND2P30279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND2P30279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND2P30279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND2P30279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND2P30279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND2P30279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCND2P30279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCND2P30279 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND2P30279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND2P30279 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND2P30279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND2P30279 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND2P30279 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND2P30279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND2P30279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND2P30279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND2P30279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND2P30279 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND2P30279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND2P30279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND2P30279 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND2P30279 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND2P30279 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND2P30279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND2P30279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND2P30279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND2P30279 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND2P30279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND2P30279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND2P30279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms