Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5DP30049 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP5DP30049 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5DP30049 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms