Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBMS1P29558 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBMS1P29558 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms