Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO1P25800 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO1P25800 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO1P25800 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO1P25800 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO1P25800 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO1P25800 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO1P25800 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO1P25800 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO1P25800 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO1P25800 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO1P25800 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO1P25800 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO1P25800 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO1P25800 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO1P25800 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO1P25800 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO1P25800 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO1P25800 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO1P25800 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO1P25800 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO1P25800 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO1P25800 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO1P25800 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO1P25800 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO1P25800 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMO1P25800 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO1P25800 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO1P25800 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO1P25800 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO1P25800 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO1P25800 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO1P25800 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO1P25800 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO1P25800 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO1P25800 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO1P25800 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO1P25800 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO1P25800 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO1P25800 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO1P25800 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms