Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSSP25774 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSSP25774 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSSP25774 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSSP25774 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSSP25774 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSSP25774 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSSP25774 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSSP25774 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSSP25774 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSSP25774 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSSP25774 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSSP25774 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSSP25774 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSSP25774 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSSP25774 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTSSP25774 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSSP25774 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSSP25774 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSSP25774 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSSP25774 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSSP25774 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSSP25774 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSSP25774 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSSP25774 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSSP25774 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSSP25774 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSSP25774 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms