Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX1P22670 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX1P22670 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX1P22670 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX1P22670 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX1P22670 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX1P22670 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX1P22670 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX1P22670 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX1P22670 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX1P22670 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX1P22670 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX1P22670 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX1P22670 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX1P22670 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX1P22670 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX1P22670 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX1P22670 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX1P22670 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX1P22670 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX1P22670 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX1P22670 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX1P22670 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX1P22670 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX1P22670 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX1P22670 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX1P22670 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX1P22670 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX1P22670 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX1P22670 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX1P22670 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX1P22670 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX1P22670 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX1P22670 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX1P22670 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX1P22670 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX1P22670 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RFX1P22670 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX1P22670 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX1P22670 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX1P22670 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX1P22670 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX1P22670 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX1P22670 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX1P22670 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms