Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH3P22223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH3P22223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH3P22223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH3P22223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH3P22223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH3P22223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH3P22223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH3P22223 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH3P22223 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH3P22223 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH3P22223 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH3P22223 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH3P22223 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH3P22223 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH3P22223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH3P22223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH3P22223 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH3P22223 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH3P22223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH3P22223 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH3P22223 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH3P22223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH3P22223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH3P22223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH3P22223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH3P22223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH3P22223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH3P22223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms