Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCLP19338 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCLP19338 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCLP19338 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCLP19338 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCLP19338 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCLP19338 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCLP19338 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCLP19338 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCLP19338 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCLP19338 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCLP19338 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCLP19338 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCLP19338 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCLP19338 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCLP19338 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCLP19338 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NCLP19338 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCLP19338 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCLP19338 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCLP19338 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCLP19338 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCLP19338 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCLP19338 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCLP19338 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCLP19338 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCLP19338 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCLP19338 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCLP19338 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCLP19338 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCLP19338 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCLP19338 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCLP19338 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCLP19338 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCLP19338 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCLP19338 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCLP19338 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCLP19338 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCLP19338 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCLP19338 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCLP19338 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCLP19338 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCLP19338 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCLP19338 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCLP19338 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCLP19338 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCLP19338 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NCLP19338 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCLP19338 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCLP19338 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCLP19338 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCLP19338 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCLP19338 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCLP19338 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCLP19338 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCLP19338 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCLP19338 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCLP19338 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCLP19338 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCLP19338 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCLP19338 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCLP19338 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCLP19338 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NCLP19338 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCLP19338 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCLP19338 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCLP19338 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCLP19338 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms