Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB5P18084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB5P18084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB5P18084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB5P18084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms