Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP2A2P16615 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2A2P16615 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A2P16615 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms