Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PLS3P13797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLS3P13797 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLS3P13797 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLS3P13797 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLS3P13797 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PLS3P13797 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLS3P13797 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLS3P13797 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLS3P13797 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLS3P13797 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLS3P13797 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLS3P13797 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLS3P13797 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLS3P13797 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLS3P13797 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLS3P13797 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLS3P13797 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLS3P13797 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLS3P13797 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLS3P13797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLS3P13797 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLS3P13797 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLS3P13797 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLS3P13797 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLS3P13797 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLS3P13797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLS3P13797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLS3P13797 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLS3P13797 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLS3P13797 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLS3P13797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.7 ms