Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCP1P13796 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCP1P13796 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCP1P13796 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCP1P13796 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCP1P13796 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCP1P13796 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCP1P13796 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCP1P13796 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCP1P13796 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCP1P13796 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCP1P13796 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCP1P13796 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCP1P13796 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCP1P13796 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LCP1P13796 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCP1P13796 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCP1P13796 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LCP1P13796 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LCP1P13796 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LCP1P13796 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCP1P13796 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCP1P13796 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCP1P13796 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCP1P13796 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCP1P13796 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCP1P13796 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCP1P13796 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCP1P13796 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCP1P13796 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LCP1P13796 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCP1P13796 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCP1P13796 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCP1P13796 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCP1P13796 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCP1P13796 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCP1P13796 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCP1P13796 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCP1P13796 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCP1P13796 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCP1P13796 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCP1P13796 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCP1P13796 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCP1P13796 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCP1P13796 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCP1P13796 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCP1P13796 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCP1P13796 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCP1P13796 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCP1P13796 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCP1P13796 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCP1P13796 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCP1P13796 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCP1P13796 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCP1P13796 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCP1P13796 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCP1P13796 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LCP1P13796 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCP1P13796 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCP1P13796 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCP1P13796 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms