Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK4P11802 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK4P11802 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK4P11802 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK4P11802 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK4P11802 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK4P11802 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK4P11802 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK4P11802 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK4P11802 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK4P11802 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK4P11802 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK4P11802 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK4P11802 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK4P11802 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK4P11802 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK4P11802 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK4P11802 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK4P11802 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK4P11802 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK4P11802 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK4P11802 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK4P11802 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK4P11802 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK4P11802 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK4P11802 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK4P11802 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK4P11802 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK4P11802 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK4P11802 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK4P11802 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK4P11802 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK4P11802 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK4P11802 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK4P11802 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK4P11802 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK4P11802 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK4P11802 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK4P11802 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK4P11802 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK4P11802 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK4P11802 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK4P11802 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK4P11802 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK4P11802 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK4P11802 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK4P11802 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK4P11802 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms