Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP10827 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP10827 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP10827 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP10827 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP10827 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP10827 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP10827 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP10827 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP10827 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP10827 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP10827 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP10827 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP10827 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP10827 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP10827 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP10827 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THRAP10827 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THRAP10827 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THRAP10827 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THRAP10827 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THRAP10827 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THRAP10827 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THRAP10827 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THRAP10827 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THRAP10827 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THRAP10827 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THRAP10827 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THRAP10827 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THRAP10827 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THRAP10827 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THRAP10827 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THRAP10827 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THRAP10827 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THRAP10827 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THRAP10827 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THRAP10827 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THRAP10827 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THRAP10827 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THRAP10827 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THRAP10827 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THRAP10827 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THRAP10827 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
THRAP10827 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THRAP10827 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THRAP10827 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
THRAP10827 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THRAP10827 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
THRAP10827 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THRAP10827 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THRAP10827 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THRAP10827 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THRAP10827 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THRAP10827 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THRAP10827 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THRAP10827 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THRAP10827 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THRAP10827 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THRAP10827 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THRAP10827 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
THRAP10827 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THRAP10827 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THRAP10827 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms