Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
OPN1MW3P0DN78 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OPN1MW3P0DN78 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms