Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR2MP0CAP2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2MP0CAP2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms