Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK3P0C264 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK3P0C264 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms