Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPIP09923 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPIP09923 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPIP09923 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPIP09923 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALPIP09923 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPIP09923 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPIP09923 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALPIP09923 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPIP09923 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPIP09923 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPIP09923 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALPIP09923 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALPIP09923 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPIP09923 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPIP09923 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPIP09923 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPIP09923 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPIP09923 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPIP09923 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPIP09923 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPIP09923 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPIP09923 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPIP09923 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPIP09923 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPIP09923 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPIP09923 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPIP09923 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPIP09923 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPIP09923 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPIP09923 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPIP09923 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPIP09923 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPIP09923 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPIP09923 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPIP09923 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPIP09923 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPIP09923 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPIP09923 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPIP09923 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPIP09923 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPIP09923 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPIP09923 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPIP09923 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPIP09923 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPIP09923 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPIP09923 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPIP09923 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPIP09923 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPIP09923 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPIP09923 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPIP09923 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPIP09923 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPIP09923 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPIP09923 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPIP09923 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPIP09923 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPIP09923 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPIP09923 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPIP09923 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms