Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXB7P09629 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HOXB7P09629 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HOXB7P09629 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms