Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPSAP08865 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPSAP08865 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPSAP08865 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPSAP08865 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPSAP08865 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPSAP08865 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPSAP08865 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPSAP08865 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPSAP08865 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPSAP08865 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPSAP08865 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPSAP08865 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPSAP08865 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPSAP08865 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPSAP08865 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPSAP08865 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPSAP08865 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPSAP08865 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPSAP08865 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPSAP08865 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPSAP08865 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPSAP08865 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPSAP08865 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPSAP08865 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPSAP08865 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPSAP08865 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPSAP08865 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPSAP08865 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPSAP08865 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPSAP08865 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPSAP08865 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPSAP08865 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPSAP08865 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPSAP08865 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPSAP08865 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPSAP08865 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPSAP08865 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPSAP08865 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPSAP08865 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPSAP08865 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPSAP08865 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPSAP08865 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPSAP08865 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPSAP08865 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPSAP08865 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPSAP08865 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPSAP08865 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms