Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRAP08240 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms