Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8BP07358 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8BP07358 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8BP07358 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8BP07358 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8BP07358 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C8BP07358 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8BP07358 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C8BP07358 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8BP07358 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8BP07358 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8BP07358 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8BP07358 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8BP07358 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8BP07358 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8BP07358 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8BP07358 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8BP07358 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8BP07358 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8BP07358 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8BP07358 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8BP07358 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C8BP07358 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C8BP07358 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8BP07358 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms