Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDHBP07195 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDHBP07195 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHBP07195 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHBP07195 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHBP07195 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDHBP07195 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDHBP07195 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDHBP07195 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDHBP07195 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHBP07195 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHBP07195 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHBP07195 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHBP07195 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHBP07195 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDHBP07195 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHBP07195 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHBP07195 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHBP07195 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHBP07195 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDHBP07195 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHBP07195 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHBP07195 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHBP07195 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHBP07195 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDHBP07195 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDHBP07195 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LDHBP07195 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDHBP07195 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LDHBP07195 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LDHBP07195 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LDHBP07195 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDHBP07195 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDHBP07195 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDHBP07195 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHBP07195 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHBP07195 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHBP07195 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDHBP07195 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LDHBP07195 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LDHBP07195 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDHBP07195 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDHBP07195 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDHBP07195 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDHBP07195 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHBP07195 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHBP07195 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHBP07195 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHBP07195 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHBP07195 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHBP07195 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHBP07195 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHBP07195 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHBP07195 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHBP07195 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHBP07195 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHBP07195 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHBP07195 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHBP07195 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHBP07195 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHBP07195 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHBP07195 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHBP07195 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms