Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPIND1P05546 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPIND1P05546 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms