Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYBBP04839 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYBBP04839 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYBBP04839 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYBBP04839 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYBBP04839 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYBBP04839 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYBBP04839 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYBBP04839 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYBBP04839 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYBBP04839 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CYBBP04839 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYBBP04839 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYBBP04839 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYBBP04839 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYBBP04839 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYBBP04839 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYBBP04839 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYBBP04839 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYBBP04839 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYBBP04839 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CYBBP04839 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYBBP04839 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYBBP04839 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYBBP04839 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYBBP04839 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYBBP04839 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYBBP04839 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYBBP04839 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYBBP04839 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYBBP04839 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYBBP04839 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYBBP04839 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYBBP04839 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYBBP04839 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYBBP04839 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYBBP04839 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYBBP04839 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYBBP04839 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms