Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF2P04141 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF2P04141 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF2P04141 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF2P04141 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF2P04141 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF2P04141 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF2P04141 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF2P04141 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF2P04141 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF2P04141 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF2P04141 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF2P04141 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF2P04141 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF2P04141 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF2P04141 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF2P04141 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF2P04141 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF2P04141 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF2P04141 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF2P04141 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF2P04141 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF2P04141 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF2P04141 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF2P04141 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF2P04141 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF2P04141 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF2P04141 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF2P04141 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF2P04141 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF2P04141 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF2P04141 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF2P04141 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF2P04141 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF2P04141 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF2P04141 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF2P04141 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF2P04141 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF2P04141 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF2P04141 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF2P04141 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF2P04141 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF2P04141 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF2P04141 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF2P04141 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF2P04141 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF2P04141 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF2P04141 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF2P04141 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF2P04141 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF2P04141 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF2P04141 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF2P04141 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF2P04141 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF2P04141 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF2P04141 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF2P04141 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF2P04141 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF2P04141 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF2P04141 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF2P04141 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms