Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTNP04004 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VTNP04004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTNP04004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTNP04004 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTNP04004 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VTNP04004 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VTNP04004 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VTNP04004 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VTNP04004 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VTNP04004 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VTNP04004 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTNP04004 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTNP04004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTNP04004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VTNP04004 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VTNP04004 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VTNP04004 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VTNP04004 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VTNP04004 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VTNP04004 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VTNP04004 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VTNP04004 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VTNP04004 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VTNP04004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTNP04004 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTNP04004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTNP04004 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VTNP04004 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTNP04004 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTNP04004 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTNP04004 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTNP04004 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VTNP04004 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTNP04004 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTNP04004 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTNP04004 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTNP04004 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTNP04004 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VTNP04004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VTNP04004 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VTNP04004 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VTNP04004 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTNP04004 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTNP04004 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTNP04004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTNP04004 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTNP04004 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VTNP04004 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTNP04004 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTNP04004 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTNP04004 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTNP04004 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTNP04004 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTNP04004 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTNP04004 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTNP04004 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTNP04004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTNP04004 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTNP04004 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTNP04004 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTNP04004 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTNP04004 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTNP04004 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTNP04004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTNP04004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms