Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC1P01850 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC1P01850 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms