Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMP1P01033 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMP1P01033 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMP1P01033 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIMP1P01033 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIMP1P01033 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIMP1P01033 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIMP1P01033 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIMP1P01033 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms