Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAL4O96015 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNAL4O96015 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms