Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX58O95786 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX58O95786 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX58O95786 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX58O95786 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX58O95786 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX58O95786 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX58O95786 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX58O95786 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX58O95786 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX58O95786 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX58O95786 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX58O95786 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX58O95786 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX58O95786 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX58O95786 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX58O95786 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX58O95786 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX58O95786 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX58O95786 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX58O95786 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX58O95786 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX58O95786 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX58O95786 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX58O95786 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX58O95786 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX58O95786 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX58O95786 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX58O95786 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX58O95786 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX58O95786 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX58O95786 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX58O95786 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX58O95786 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX58O95786 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX58O95786 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX58O95786 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX58O95786 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX58O95786 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX58O95786 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX58O95786 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX58O95786 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX58O95786 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX58O95786 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX58O95786 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
DDX58O95786 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
DDX58O95786 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX58O95786 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX58O95786 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX58O95786 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX58O95786 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX58O95786 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX58O95786 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX58O95786 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX58O95786 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX58O95786 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX58O95786 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX58O95786 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX58O95786 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX58O95786 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX58O95786 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX58O95786 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX58O95786 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX58O95786 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX58O95786 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX58O95786 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX58O95786 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX58O95786 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX58O95786 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX58O95786 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms