Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATE1O95260 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATE1O95260 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATE1O95260 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATE1O95260 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATE1O95260 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATE1O95260 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATE1O95260 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATE1O95260 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATE1O95260 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATE1O95260 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATE1O95260 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATE1O95260 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATE1O95260 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATE1O95260 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATE1O95260 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATE1O95260 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATE1O95260 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATE1O95260 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATE1O95260 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATE1O95260 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATE1O95260 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATE1O95260 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATE1O95260 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATE1O95260 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATE1O95260 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATE1O95260 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATE1O95260 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATE1O95260 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATE1O95260 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATE1O95260 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATE1O95260 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATE1O95260 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATE1O95260 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATE1O95260 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATE1O95260 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATE1O95260 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATE1O95260 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATE1O95260 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATE1O95260 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATE1O95260 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATE1O95260 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATE1O95260 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATE1O95260 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATE1O95260 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATE1O95260 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATE1O95260 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATE1O95260 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATE1O95260 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATE1O95260 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATE1O95260 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATE1O95260 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATE1O95260 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATE1O95260 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATE1O95260 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATE1O95260 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATE1O95260 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATE1O95260 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms