Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX4O95219 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX4O95219 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX4O95219 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX4O95219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX4O95219 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX4O95219 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX4O95219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX4O95219 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX4O95219 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX4O95219 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX4O95219 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX4O95219 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX4O95219 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX4O95219 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX4O95219 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX4O95219 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX4O95219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX4O95219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX4O95219 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX4O95219 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX4O95219 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX4O95219 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX4O95219 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX4O95219 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX4O95219 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX4O95219 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX4O95219 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX4O95219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX4O95219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX4O95219 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX4O95219 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX4O95219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX4O95219 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX4O95219 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX4O95219 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX4O95219 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms