Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN3O95197 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN3O95197 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN3O95197 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN3O95197 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN3O95197 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN3O95197 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN3O95197 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RTN3O95197 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN3O95197 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN3O95197 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN3O95197 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN3O95197 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN3O95197 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN3O95197 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN3O95197 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN3O95197 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN3O95197 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN3O95197 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN3O95197 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN3O95197 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN3O95197 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN3O95197 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN3O95197 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN3O95197 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN3O95197 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN3O95197 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN3O95197 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN3O95197 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN3O95197 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN3O95197 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN3O95197 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN3O95197 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN3O95197 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN3O95197 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN3O95197 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN3O95197 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTN3O95197 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN3O95197 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN3O95197 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN3O95197 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN3O95197 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN3O95197 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN3O95197 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms