Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAMP5O95183 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP5O95183 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
VAMP5O95183 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VAMP5O95183 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP5O95183 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP5O95183 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms