Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGR5O75473 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGR5O75473 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGR5O75473 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LGR5O75473 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LGR5O75473 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGR5O75473 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LGR5O75473 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGR5O75473 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LGR5O75473 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LGR5O75473 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LGR5O75473 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LGR5O75473 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LGR5O75473 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LGR5O75473 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGR5O75473 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGR5O75473 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGR5O75473 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGR5O75473 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGR5O75473 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGR5O75473 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGR5O75473 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGR5O75473 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGR5O75473 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGR5O75473 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGR5O75473 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGR5O75473 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGR5O75473 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGR5O75473 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGR5O75473 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGR5O75473 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGR5O75473 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LGR5O75473 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGR5O75473 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LGR5O75473 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGR5O75473 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGR5O75473 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGR5O75473 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGR5O75473 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGR5O75473 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGR5O75473 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LGR5O75473 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LGR5O75473 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LGR5O75473 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LGR5O75473 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGR5O75473 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGR5O75473 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGR5O75473 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGR5O75473 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGR5O75473 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGR5O75473 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGR5O75473 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms