Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT3O75175 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT3O75175 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT3O75175 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms