Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR5O60602 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR5O60602 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR5O60602 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR5O60602 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR5O60602 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR5O60602 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR5O60602 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR5O60602 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR5O60602 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR5O60602 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR5O60602 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TLR5O60602 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TLR5O60602 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR5O60602 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR5O60602 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR5O60602 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR5O60602 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR5O60602 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR5O60602 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR5O60602 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR5O60602 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR5O60602 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR5O60602 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR5O60602 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR5O60602 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR5O60602 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR5O60602 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR5O60602 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR5O60602 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR5O60602 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR5O60602 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR5O60602 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR5O60602 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TLR5O60602 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR5O60602 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR5O60602 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR5O60602 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR5O60602 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR5O60602 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR5O60602 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR5O60602 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR5O60602 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR5O60602 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR5O60602 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR5O60602 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TLR5O60602 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms