Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms