Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME2P1O60361 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms