Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC26A4O43511 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A4O43511 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC26A4O43511 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC26A4O43511 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms