Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNAB3O43448 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNAB3O43448 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms