Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHHO43323 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHHO43323 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHHO43323 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHHO43323 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHHO43323 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHHO43323 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHHO43323 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHHO43323 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHHO43323 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHHO43323 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHHO43323 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHHO43323 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHHO43323 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHHO43323 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHHO43323 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHHO43323 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHHO43323 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHHO43323 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHHO43323 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHHO43323 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHHO43323 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHHO43323 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHHO43323 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHHO43323 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DHHO43323 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHHO43323 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHHO43323 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHHO43323 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHHO43323 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHHO43323 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHHO43323 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHHO43323 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHHO43323 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHHO43323 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHHO43323 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHHO43323 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms