Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRGAP3O43295 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRGAP3O43295 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP3O43295 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms